Kiss x Sis to anime łączące gatunki ecchi i komedii z elementami romansu, przedstawiające złożoną relację między Keitą Suminoe a jego przyrodnimi siostrami – bliźniaczkami Ako i Riko. Seria porusza się na pograniczu tabu, prezentując połączenie pikantnych momentów, humoru i delikatnego dramatu rodzinnego.
Keita Suminoe, główny bohater, po stracie matki otrzymuje nową rodzinę – jego ojciec wstępuje w nowy związek małżeński, a Keita zyskuje dwie starsze przyrodnie siostry. Kłopotliwe jest to, że Ako i Riko od pierwszego spotkania żywią do niego uczucia wykraczające poza typową siostrzaną miłość. Od tego czasu współzawodniczą o jego zainteresowanie, nieustannie go kusząc i przekształcając jego codzienność w serię krępujących, ale i ekscytujących doświadczeń.
Historia rozpoczyna się, gdy Keita przygotowuje się do egzaminów wstępnych do liceum uczęszczanego przez jego siostry. Musi skoncentrować się na nauce, jednocześnie konfrontując się z własnymi emocjami – czy powinien odrzucić ich awanse, czy może ulec pokusie? Sytuacja komplikuje się, gdy okazuje się, że nie tylko Ako i Riko są nim zainteresowane – wraz z rozwojem fabuły pojawiają się kolejne dziewczyny, stawiające przed nim wyzwania zarówno emocjonalne, jak i fizyczne.