Shuumatsu no Harem (World’s End Harem) to anime science-fiction z elementami ecchi, które rozgrywa się w postapokaliptycznym świecie dotkniętym globalną pandemią. Główny bohater, Reito Mizuhara, jest studentem medycyny, który z powodu rzadkiej i śmiertelnej choroby – stwardnienia komórkowego – zostaje poddany kriogenicznemu zamrożeniu na pięć lat. Po przebudzeniu odkrywa, że świat, który znał, zmienił się nie do poznania.
Rok po jego zamrożeniu wybuchła pandemia spowodowana wirusem MK (Male Killer), który zabija wyłącznie mężczyzn. W wyniku tej choroby niemal wszyscy mężczyźni na Ziemi zginęli. Reito oraz czterech innych mężczyzn, którzy również byli w stanie kriogenicznego snu, okazali się odporni na wirusa i są teraz jedynymi ocalałymi mężczyznami na świecie. W nowej rzeczywistości ich głównym zadaniem jest współpraca z rządem i naukowcami, aby pomóc w odtworzeniu populacji ludzkiej poprzez spłodzenie jak największej liczby potomstwa z kobietami.
Jednak Reito nie jest zainteresowany takim życiem. Jego serce należy do jego przyjaciółki z dzieciństwa i jedynej miłości, Elisy Tachibany. Niestety, dowiaduje się, że Elisa zaginęła trzy lata przed jego przebudzeniem. Podczas gdy inni mężczyźni poddają się nowemu porządkowi świata, Reito postanawia odnaleźć Elisę, stawiając czoła licznym pokusom i zagadkom związanym z wirusem MK oraz światem, który poznaje od nowa.
