Great Teacher Onizuka to nietypowa historia o byłym członku gangu motocyklowego, który postanawia zostać nauczycielem. Główny bohater, 22-letni Eikichi Onizuka, znany wcześniej jako przywódca gangu i zdobywca Shonan, podejmuje się tego wyzwania z dość przyziemnych pobudek – marzy o znalezieniu młodej żony.
Los stawia przed nim nie lada wyzwanie, gdy otrzymuje posadę wychowawcy klasy 3-4 w prestiżowej Holy Forest Academy. Ta szczególna klasa zasłynęła z tego, że doprowadza swoich nauczycieli do załamania nerwowego poprzez wyrafinowaną wojnę psychologiczną, zmuszając ich do rezygnacji. Jednak Onizuka, mimo swojej kontrowersyjnej przeszłości i niekonwencjonalnych metod (włącznie z wykonaniem suplexu na wicedyrektorze), okazuje się być dokładnie tym, czego potrzebują jego uczniowie.
Seria porusza poważne problemy współczesnej młodzieży, takie jak znęcanie się, myśli samobójcze czy molestowanie seksualne. Onizuka, wykorzystując swoją ekscentryczną osobowość i niestandardowe podejście pedagogiczne, pomaga uczniom stawić czoła ich traumom i problemom. Jego metody mogą wydawać się szalone – jak choćby skakanie z budynku, by powstrzymać ucznia przed samobójstwem – ale okazują się skuteczne w docieraniu do młodych ludzi.
To historia o tym, jak niepozorny były przestępca, kierując się swoim specyficznym kodeksem moralnym i autentyczną troską o uczniów, staje się dla nich kimś więcej niż tylko nauczycielem. Pokazuje, że czasami najbardziej niekonwencjonalne metody i najbardziej nieprawdopodobni bohaterowie mogą przynieść najlepsze rezultaty w dotarciu do zagubionych młodych ludzi. Dzięki swojemu unikalnemu podejściu, Onizuka powoli zmienia nastawienie uczniów do szkoły, ucząc ich, że nauka może być również przyjemnością.