W roku 0079 Uniwersalnego Stulecia ludzkość przeniosła się w przestrzeń kosmiczną, zamieszkując skupiska kolonii zwane „Stronami”. Jedna z nich, ogłaszająca się „Księstwem Zeon”, wypowiedziała wojnę Federacji Ziemskiej, która sprawowała władzę nad planetą. Zeon, korzystając z zaawansowanej technologii w postaci potężnych robotów zwanych „mobilnymi kombinezonami”, szybko zyskał przewagę na polu bitwy.
Po dziewięciu miesiącach od rozpoczęcia wojny, Federacja Ziemska opracowała własną odpowiedź – zaawansowany mobilny kombinezon o nazwie Gundam. Gdy Zeon atakuje kolonię, w której przechowywany jest ten nowy oręż, młody 15-letni cywil, Amuro Ray, zostaje nieoczekiwanie wciągnięty w wir konfliktu. Jego podróż poprowadzi go zarówno przez Ziemię, jak i przestrzeń kosmiczną, gdzie stanie twarzą w twarz z Char Aznable, jednym z najniebezpieczniejszych pilotów wrogiej armii.