„Made in Abyss Movie 3: Fukaki Tamashii no Reimei” to dramatyczna kontynuacja epickiej podróży Riko, Rega i Nanachi w głąb Otchłani. Po bolesnych stratach i trudnych decyzjach trójka przyjaciół wkracza do piątej warstwy – Morza Ciał, granicy, z której powrót bez utraty człowieczeństwa jest jeszcze możliwy. Jednak na ich drodze staje Bondrewd – zamaskowany naukowiec i sadystyczny władca tej części Otchłani, który nie zamierza pozwolić im przejść dalej bez zapłacenia straszliwej ceny.
Dla Nanachiego spotkanie z Bondrewdem to nie tylko kolejna przeszkoda, ale powrót do traumatycznej przeszłości. Przerażające eksperymenty naukowca na niewinnych dzieciach pozostawiły niezatarte blizny, a jego obecność pogrąża Nanachiego w wewnętrznym chaosie.
Niespodziewanym promieniem nadziei staje się Prushka – energiczna dziewczynka, która uważa Bondrewda za swojego ojca. Gdy Riko, Reg i Nanachi nawiązują z nią przyjaźń, dostrzegają w niej klucz do pokonania potężnego przeciwnika i przełamania bariery szóstego poziomu Otchłani.