Rok po wydarzeniach w Sanktuarium, Subaru Natsuki ciężko trenuje, przygotowując się na nadchodzące wyzwania w niebezpiecznym świecie, w którym nieustannie stawia czoła śmierci i cierpieniu. Spokojne dni pełne treningów szybko zostają przerwane, gdy Emilia otrzymuje zaproszenie na spotkanie z Anastasii Hoshi w Watergate City of Priestella. Z uwagi na wagę tego spotkania i potencjalne zagrożenia, Subaru postanawia towarzyszyć Emilii, a razem z nimi w podróż wyruszają ich wierni przyjaciele.
W Priestelli, gdzie Subaru ponownie spotyka swoich dawnych towarzyszy, pojawiają się nowi, potężni wrogowie. Z fanatycznymi motywacjami i bezwzględnymi metodami siania grozy i zniszczenia. Nowi adwersarze stają się zagrożeniem dla Emilii oraz dla całego miasta. Kierowani własnymi ambicjami, planują zniszczenie wszystkiego, co Subaru i jego przyjaciele starali się ochronić. By powstrzymać nadciągające niebezpieczeństwo, Subaru musi ponownie stanąć do walki, zmierzając się z siłami, które pragną zniszczyć to, co dla niego najcenniejsze.
