Surrealistyczny świat Tenshi no Tamago to opustoszała kraina, pozbawiona jakiegokolwiek śladu codziennego życia. Zamiast tego, wypełniony jest mrocznymi i niepokojącymi zjawiskami: pływające kule kryjące posągi bogiń, gigantyczne, bezzałogowe czołgi przemierzające opustoszałe tereny, armie rybaków desperacko ścigających cienie ryb, które nie istnieją, oraz jaskinie ozdobione jedynie szklanymi naczyniami pełnymi wody.
W tej zrujnowanej rzeczywistości, młoda dziewczyna niesie ze sobą duże jajo, dbając o nie, podczas gdy szuka pożywienia i wody. Jej droga krzyżuje się z tajemniczym mężczyzną noszącym na ramieniu krzyż, który staje się zainteresowany zarówno dziewczyną, jak i tym, co skrywa jej jajo. Wspólnie wyruszają w podróż przez zniszczony krajobraz, zadając pytania o naturę wiary, sens istnienia świata oraz tajemnicze pochodzenie ich własnego życia.