„Youkoso Jitsuryoku Shijou Shugi no Kyoushitsu e 2nd Season” (znane również jako „Classroom of the Elite Season 2”) to kontynuacja psychologicznego thrillera osadzonego w elitarnej szkole średniej.
Historia rozpoczyna się bezpośrednio po wydarzeniach z pierwszego sezonu, gdy uczniowie Tokyo Metropolitan Advanced Nurturing High School wracają z wymagającego egzaminu na wyspie. Jednak zamiast odpoczynku, zostają natychmiast wrzuceni w wir kolejnego specjalnego testu, gdzie stawką są cenne punkty.
W centrum wydarzeń znajduje się enigmatyczny Kiyotaka Ayanokouji, uczeń klasy D, który mimo pozorów przeciętności skrywa niezwykłe zdolności manipulacji i strategicznego myślenia. Musi zmierzyć się z dwoma głównymi wyzwaniami:
Pierwszym jest Kakeru Ryuuen – bezwzględny lider innej klasy, który po porażce w poprzednim teście jest gotów użyć wszelkich środków, by zdominować rywalizację. Drugim problemem jest kryzys Kei Karuizawy, kluczowej uczennicy klasy D, której traumatyczna przeszłość grozi załamaniem się pod presją obecnej sytuacji.
Seria pokazuje skomplikowaną sieć intryg, manipulacji i strategicznych posunięć, gdzie każdy uczeń musi walczyć o przetrwanie w bezwzględnym systemie szkolnym. Ayanokouji, działając z cienia, wykorzystuje swoje umiejętności planowania i przewidywania, by chronić klasę D przed wrogimi siłami, jednocześnie realizując własne, nieznane nikomu cele.